Роден в град Бургос, Испания, през 1933 година в семейство на немски емигранти. Завършва цигулка, пиано и композиция в Консерваториите в Билбао и Мадрид. През 1953 постъпва за период от три години на задължителна военна служба. „Спечелих конкурс да ръководя военната група – втората най-добра работа в армията“, каза той. И допълва в едно свое интервю, че времето прекарано там е от изключително значение в живота му. „Налагаше ми се да преписвам стотици симфонии, това определено разви до съвършенство моята фотографската памет. И разбира се определи моя стил на дирижиране, характеризиращ се с военни движения на ръката“. След приключване на службата той продължава образованието си в Musikhochschule в Мюнхен, където му преподава Паул Хиндемит. След като се завръща в Испания, започва стремителната му кариера. През 1958-а той е назначен като главен диригент на Симфоничния оркестър на Билбао. След участие на състава в музикален фестивал във Франция, младият диригент решава да добави към фамилното си име града, в който е роден. „Трябва да направя нещо, трудно обяснявам с това немско име, че всъщност съм испанец“ казва самият Рафаел Фрюбек де Бургос. И така с това добавяне на де Бургос той става известен в родината си като „патриарха на диригентите“ и като „най-интернационалната диригентска палка“ на Испания.
Неговият испански репертоар е огромен, той отдава нужната почит към авторите Мануел де Файя, Исак Албенис, но дава живот и на произведения на не толкова известни композитори. Почеркът му се разпознава в невероятно изискания звук, който успява да вдъхне на всеки оркестър, с който някога е работил. След Билбао той заема същия пост в Националния оркестър на Испания, Симфоничния оркестър на Дюселдорф, Монреал и Виена. В кариерата си е работил като директор на „Дойче опер“ Берлин, Берлинските радиосимфоници, Националния симфоничен оркестър на РАИ в Торино. Бил е артистичен директор и диригент на Дрезденската филхармония, а след това и главен диригент на Датския национален симфоничен оркестър, с който изнася последния си концерт на 14 март 2014 във Вашингтон. Извън пределите на Европа Рафаел Фрюбек де Бургос се превръща в любим диригент и на множество престижни американски и канадските оркестри, което води до 35-годишни отношения с оркестъра на Филаделфия и повече от 15 последователни години начело на Бостънската симфония. Сред впечатленията, които е оставил в оркестрантите, имали честта да работят с него, е методът на провеждане на репетициите, голямото му чувство за хумор, неговата почтеност по всички въпроси, професионални и лични и топлината и голямото му уважение към тях и музиката. Получил е и множество награди, сред тях са Златен медал на Международното общество Густав Малер – Виена, Сребърен почетен знак за заслуги към Република Австрия, Златен медал за изящни изкуства, връчен му от испанския крал Хуан Карлос I през 2009, Диригент на годината от списание Musical America през 2010. Обявен е за Доктор Хонорис Кауза на университетите на Навара и Бургос.
В Музикалната вечер на 16 септември от 22 часа ще чуете: Концертино за китара и оркестър в ла минор от Салвадор Бакарисе, Испанска сюита от Исак Албенис, Симфония № 3 „Ероика“ от Лудвиг ван Бетовен.